Instrument for Measuring plant phenotype — Model PhenoGA 

一、用途
基因型、表型和環(huán)境是遺傳學(xué)研究的鐵三角。表型（性狀）是基因型和環(huán)境共同作用結(jié)果，而基因型與表型之間有著多重關(guān)系。研究者用測(cè)序和基因組重測(cè)序來(lái)評(píng)估等位基因差異定位數(shù)量性狀等已變得很普遍，但其需大量性狀數(shù)據(jù)來(lái)佐證。然而這類分析測(cè)量的結(jié)果受人員、工具和環(huán)境等的干擾很大，還會(huì)損傷到植物。高效、準(zhǔn)確的萬(wàn)深PhenoGA植物表型分析測(cè)量?jī)x實(shí)現(xiàn)了可視化的精確數(shù)據(jù)分析和表型測(cè)試，如測(cè)試對(duì)壓力和環(huán)境因素的表型反應(yīng)、生態(tài)毒理學(xué)測(cè)試或萌發(fā)測(cè)定、遺傳育種研究、突變株篩選、植物形態(tài)建模、生長(zhǎng)研究等。
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二、主要性能指標(biāo)
1、成像
（1）雙彩色相機(jī)：由頂視和側(cè)視的超大變焦鏡頭自動(dòng)對(duì)焦2400萬(wàn)像素以上的佳能EOS單反相機(jī)直連電腦獲取植物頂視和側(cè)視的RGB彩色圖。
（2）紅外光雙目3D相機(jī)：由頂部的主動(dòng)紅外光的雙目3D相機(jī)（點(diǎn)云密度1024*1024像素）來(lái)獲取植物冠層的3D景深偽彩色圖和可轉(zhuǎn)換視角的3D重建偽彩色圖。
（3）拍攝箱：外尺寸200cm高*120cm長(zhǎng)*120cm寬，可成像分析植株高可達(dá)150cm、可測(cè)最大葉冠幅115cm*115cm。
2、分析軟件
（1）常規(guī)分析：投影葉面積及其動(dòng)態(tài)變化，外周長(zhǎng)，外接圓直徑及面積，擬合橢圓主副軸及偏角，凸包內(nèi)徑、面積及周長(zhǎng)，植株高、寬，最小外接矩形長(zhǎng)、寬，植株緊實(shí)度。
（2）顏色分析：RGB、LAB顏色值，具有葉片顏色自動(dòng)矯正特性，可按英國(guó)皇家園林協(xié)會(huì)RHS比色卡2015版來(lái)自動(dòng)比色。可按指定顏色數(shù)進(jìn)行聚類分割，并統(tǒng)計(jì)顏色分布及面積占比。
（3）骨架分析：骨架長(zhǎng)度，端點(diǎn)數(shù)（葉片數(shù)），分叉數(shù)（分枝數(shù)、分節(jié)數(shù)），莖葉夾角等。
（4）玉米株形分析：葉片數(shù)，葉片長(zhǎng)、寬，葉片彎曲度，葉片投影面積，莖稈分節(jié)數(shù)，分節(jié)長(zhǎng)、粗，葉片顏色等，并可編輯。
（5）生長(zhǎng)分析：植株絕對(duì)生長(zhǎng)、相對(duì)生長(zhǎng)曲線，相對(duì)生長(zhǎng)趨勢(shì)。
（6）根系分析：根長(zhǎng)，根粗，根尖數(shù)等（要求根粗>1mm）。
（7）考種分析：種粒數(shù)，種粒面積，種粒長(zhǎng)、寬（種粒直徑>2mm，不粘連），分析種子形態(tài)、果實(shí)外觀品質(zhì)、花形和花色。
（8）其它：不同生長(zhǎng)時(shí)期自動(dòng)批量化處理分析，多植株網(wǎng)格分析，直線、角度等幾何測(cè)量，各測(cè)量結(jié)果可編輯修正。
3、數(shù)據(jù)報(bào)表
（1）可接入條碼槍來(lái)自動(dòng)刷入樣品編號(hào)，具有按條碼標(biāo)識(shí)跟蹤分析的特性。
（2）各項(xiàng)分析數(shù)據(jù)和標(biāo)記圖片可導(dǎo)出。

三、標(biāo)準(zhǔn)配置
1、萬(wàn)深PhenoGA植物表型分析測(cè)量?jī)x軟件光盤及軟件鎖1套
2、超大變焦鏡頭自動(dòng)對(duì)焦2400萬(wàn)像素以上的佳能EOS單反相機(jī)2套
3、主動(dòng)紅外光的雙目3D相機(jī)（深度相機(jī)+RGB相機(jī)）及適配器1套
4、單反相機(jī)拍攝支架1套
5、含光源的拍攝箱（200cm高*120cm長(zhǎng)*120cm寬）1套
6、葉色色彩矯正板+尺寸自動(dòng)標(biāo)定板及其座板 1付
7、可承重25kg盆栽植株的升降臺(tái)1付
8、可承重25kg電動(dòng)轉(zhuǎn)臺(tái)1套
9、手持式條形碼閱讀器1付
10、超薄背光燈板1付
11、掌式便攜小背光板1付
12、品牌電腦（12代酷睿i5 CPU / 16G內(nèi)存/ 512G硬盤以上 / 23”彩顯/無(wú)線網(wǎng)卡，2個(gè)USB3.0和2個(gè)USB2.0口，Windows 完整專業(yè)版）1臺(tái)

四、可選配硬件
1、紅外熱成像相機(jī)（分辨率 384*288像素，測(cè)溫范圍-20-150℃，測(cè)溫精度為最大測(cè)溫范圍絕對(duì)值的±2%），以測(cè)定葉溫和葉溫分布。
2、近紅外成像相機(jī)(NIR)，以定性分析植物葉片水分分布情況。
3、真正3D成像的手持式掃描儀，以獲得植物真3D模型。
4、可定制大到250cm高*120cm長(zhǎng)*120cm寬的拍攝箱，或田間頂視檢測(cè)版的分析儀，以適應(yīng)特殊應(yīng)用需求。
5、LA-S手機(jī)版葉面積分析軟件，可用于野外的方便成像與分析葉面積。
6、RootGA根系動(dòng)態(tài)生長(zhǎng)監(jiān)測(cè)分析儀，以分析植株根系的脅迫響應(yīng)等。

玉米株形分析

生長(zhǎng)分析

葉冠顏色分析

花朵顏色分析

玉米骨架分析

油菜頂視圖表型分析

油菜側(cè)視圖表型分析

水稻頂視圖葉片數(shù)統(tǒng)計(jì)

水稻側(cè)視圖表型分析

根長(zhǎng)、根粗測(cè)量

多植株表型分析

多植株表型分析

種粒計(jì)數(shù)分析

多葉分析

單葉分析